В команду, занимающуюся секвенированием (расшифровкой) генома утки, входили учёные из Китайского института сельского хозяйства (China Agricultural University), Пекинского института изучения генома (BGI), Эдинбургского университета (University of Edinburgh) и многих других научных центров.
Недавно исследователи завершили расшифровку и анализ генома утки кряквы (Anas platyrhynchos), которая является естественным носителем вируса птичьего гриппа А, вспышка которого вновь была зафиксирована в Китае в феврале 2013 года.
Новый штамм опасного вируса H7N9 убил 36 человек и нанёс ущерб в 6,5 миллиарда по экономике Поднебесной. Естественным носителем вируса птичьего гриппа А, в число которых входит H5N1, является дикая утка кряква, которая не проявляет никаких симптомов заболевания даже в разгар эпидемии.
Чтобы выявить взаимодействие между организмом переносчика и самим вирусом, учёные секвенировали геном самки утки, которой было 10 недель от роду. Также исследователи провели анализ транскриптома двух других уток, заражённых вирусом.
Это был первый раз, когда учёные расшифровали геном водоплавающей утки. Анализ первичных данных показал, что ДНК кряквы содержит целый набор "иммунных" генов, обеспечивающих защиту от заражения. Такой же наблюдался у куриц и птах зебровых амадин. Однако в отличие от последних, ДНК утки содержала новые гены, которых не было у других изученных птиц.
Исследователи провели лабораторный эксперимент, в ходе которого сравнили экспрессию генов в лёгких птиц, заражённых либо высокопатогенным, либо низкопатогенным вирусом H5N1. Учёные выявили гены, экспрессия которых изменялась под воздействием вируса. Также они определили факторы потенциального влияния на иммунную реакцию генов утки, которые могут быть не только у птиц, но и у млекопитающих. К примеру, выделение белка дефензина.
"Наше исследование выявляет взаимосвязи между носителем и самим вирусом. При помощи расшифрованного генома утки можно будет понять также и механизм распространения и способы заражения птичьим гриппом", — заявил в пресс-релизе менеджер проекта от Пекинского института изучения генома Цзянвэнь Ли (Jianwen Li).
С результатами работы генетиков можно ознакомиться, прочитав статью в журнале Nature Genetics.
Также по теме:
Учёные ищут источник вируса гриппа H7N9
Китай обещает создать вакцину от птичьего гриппа
Геномы голубей рассказали биологам об их общем предке
Китайские учёные расшифровали геном домашней козы
Геном рыбки данио поможет в изучении редких болезней
Геном расписной черепахи поможет людям победить холод
